Sekretariat Dinas Kelautan dan Perikanan Provinsi Bengkulu bertugas mendukung kelancaran administrasi, perencanaan, keuangan, kepegawaian, tata usaha, serta urusan umum, sekaligus mengoordinasikan kegiatan antar bidang agar pelaksanaan program kelautan dan perikanan berjalan efektif, transparan, dan akuntabel.